公司企業如果違反了相關法律規定，工商部門是可以依法對其營業執照進行吊銷的。營業執照被吊銷之后要到原審批機關辦理注銷手續。注銷的手續如下：首先，要在當地市級以上的報紙上刊登注銷公告，申明公司要辦理注銷，不再經營。同時公司要成立清算小組，對其內部的債權債務、稅款、職工工資等情況進行清算，并出具清算報告。清算小組成員要到所在地工商管理部門進行登記備案手續。接下來，就可以依次辦理國地稅、工商和代碼證的注銷手續了。其中工商注銷一定要在刊登注銷公告45個工作日之后才可以進行。
法律依據：
《公司法》第一百八十八條公司注銷公司清算結束后，清算組應當制作清算報告，報股東會、股東大會或者人民法院確認，并報送公司登記機關，申請注銷公司登記，公告公司終止。

法律主觀：

公司吊銷后注銷的辦法：應當在被吊銷后十五日內成立清算組，對該公司債權、債務進行清算，并制作清算報告。按照清算報告，依法分配公司破產財產。清算結束后，應當依法申請公司注銷登記。

法律客觀：

《公司法》第一百八十三條 公司因本法第一百八十條第（一）項、第（二）項、第（四）項、第（五）項規定而解散的，應當在解散事由出現之日起十五日內成立清算組，開始清算。有限責任公司的清算組由股東組成，股份有限公司的清算組由董事或者股東大會確定的人員組成。逾期不成立清算組進行清算的，債權人可以申請人民法院指定有關人員組成清算組進行清算。人民法院應當受理該申請，并及時組織清算組進行清算。 第一百八十八條 公司清算結束后，清算組應當制作清算報告，報股東會、股東大會或者人民法院確認，并報送公司登記機關，申請注銷公司登記，公告公司終止。

已經被吊銷的公司注銷流程如下：
1、先到國稅拿表格，按國稅的要求填寫，簽字，蓋章，繳銷發票，補稅后，它會收回國稅稅務登記證，給你一張國稅注銷稅務登記通知書；
2、拿著國稅的注銷稅務登記通知書，到地稅拿表格，補稅后，它會收回地稅稅務登記證，給你一張地稅注銷稅務登記通知書；
3、拿著兩張通知書，銷銀行賬戶；
4、拿通知書到工商局拿表格，然后交回工商，它會收回營業執照。（注意工商注銷前要先在媒體上公示三次注銷公告，報樣要給工商局的）。
不營業的公司不注銷營業執照的后果具體如下：
1、公司不注銷，放任不管企業將會納入工商異常經營名單、稅務黑名單；
2、 納入異常經營名單后依然不處理，將會被吊銷；
3、工商異常、法人將不能擔任新公司的法人；
4、 稅務黑名單，欠繳稅行為，法人、高管、股東想在新公司擔任股東、高管，需要先處理稅務問題；
5、進入誠信黑名單后，法人、股東將無法出國；
6、無法乘坐高鐵、飛機；
7、法人、股東將無法辦理移民；
8、股東將無法貸款。
綜上所述，在辦理注銷營業執照的過程中，會用到許多的證件與證明材料，所以一定要妥善保管，以避免不必要的麻煩。
【法律依據】：
《中華人民共和國市場主體登記管理條例》 第三十一條
市場主體因解散、被宣告破產或者其他法定事由需要終止的，應當依法向登記機關申請注銷登記。經登記機關注銷登記，市場主體終止。
市場主體注銷依法須經批準的，應當經批準后向登記機關申請注銷登記。
第三十二條
市場主體注銷登記前依法應當清算的，清算組應當自成立之日起10日內將清算組成員、清算組負責人名單通過國家企業信用信息公示系統公告。清算組可以通過國家企業信用信息公示系統發布債權人公告。
清算組應當自清算結束之日起30日內向登記機關申請注銷登記。市場主體申請注銷登記前，應當依法辦理分支機構注銷登記。
第三十三條
市場主體未發生債權債務或者已將債權債務清償完結，未發生或者已結清清償費用、職工工資、社會保險費用、法定補償金、應繳納稅款（滯納金、罰款），并由全體投資人書面承諾對上述情況的真實性承擔法律責任的，可以按照簡易程序辦理注銷登記。
市場主體應當將承諾書及注銷登記申請通過國家企業信用信息公示系統公示，公示期為20日。在公示期內無相關部門、債權人及其他利害關系人提出異議的，市場主體可以于公示期屆滿之日起20日內向登記機關申請注銷登記。
個體工商戶按照簡易程序辦理注銷登記的，無需公示，由登記機關將個體工商戶的注銷登記申請推送至稅務等有關部門，有關部門在10日內沒有提出異議的，可以直接辦理注銷登記。
市場主體注銷依法須經批準的，或者市場主體被吊銷營業執照、責令關閉、撤銷，或者被列入經營異常名錄的，不適用簡易注銷程序。
第三十四條
人民法院裁定強制清算或者裁定宣告破產的，有關清算組、破產管理人可以持人民法院終結強制清算程序的裁定或者終結破產程序的裁定，直接向登記機關申請辦理注銷登記。