處理股東之間糾紛，首先要明確分歧來源，是因利潤分配或未來經營戰略不同所致。需理清初始股權結構，了解股權賦予的基本權利：資產所有權、經營權與分紅權。若無事先協議，分紅權按初始股權比例分配。
利潤分配引發的糾紛相對易于解決，因已有明確約定，分發數額按事先約定或特殊情況處理。
若經營策略出現分歧，需明確主導股東。在股權層面，持股67%以上者為絕對大股東，公司法下，超過2/3投票的決定可生效。持股51%為相對大股東，一般策略其同意即可執行。
初創公司股權均分，為確保各股東權益，利潤均分，無意間分配了經營權。公司成熟后，若在經營策略上分歧，無法達成一致，可能陷入僵局。此情況下，僅通過訴訟或解散公司方能解決糾紛。