專著：
1．《訴訟證明原理》，（合著：吳宏耀、魏曉娜），法律出版社2002年版。（獲第五屆中國訴訟法學會中青年優秀科研成果著作類三等獎）
2．《刑事審前程序研究》，（合著：宋英輝、吳宏耀），中國政法大學出版社2002版。
3．《刑事訴訟法實施問題與對策研究》，（參著，第二作者），中國人民公安大學出版社2001年8月版。（該書獲北京市優秀科研成果一等獎；司法部2002年度優秀科研成果二等獎）
4．《刑事證據法原理與適用》（合著，第四作者），中國人民公安大學出版社2001年4月版。
譯著：
1．《比較法視野中的證據制度》，（原著：[美]：米爾吉安.R.達馬斯卡，合譯：吳宏耀，魏曉娜等），中國人民公安大學出版社2006年10月版。
參著：
1.樊崇義主編：《訴訟原理》（第六章“訴訟認識”），法律出版社2003年10月版。
2.江偉主編：《統一證據法建議稿及理由書》（證據法“一般規定”的條文及其論證），中國人民大學出版社2004年版。
3．宋英輝主編：《刑事程序法功能研究》（第八章“ 刑事訴訟啟動程序”；第十章“ 公訴”），中國人民大學出版社2004年版。
4．陳衛東主編：《模范刑事訴訟法典》（第二編“證據”：第102條至第204條），中國人民大學出版社2005年版。
論 文：
1.《對設立非法物證排除規則的質疑》，載《法學論壇》1997年第4期 。
2.《簡論刑事訴訟法學中的主要證據的概念與范圍》（周士敏、吳宏耀），載《法學》1998年第7期。
3.《論疑罪從無原則的理論基礎》，載中國政法大學科研處編《中國政法大學優秀論文選集》（1998年卷）。（該文獲1998年中國政法大學校慶優秀論文一等獎。）
4.《任何人不受強迫自證其罪原則及其程序保障》（宋英輝、吳宏耀），載《中國法學》1999年第2期。（《人大復印資料-訴訟法》2000年全文轉載；被美國耶魯大學全文翻譯并收入“Law in Contemporary China”[YALE UNIVERSITY RIS Publishing Center Course Materials Packet (LAW21179_Pkto9) ]。該文獲全國第四屆中青年訴訟法學優秀科研成果二等獎。）
5.《刑事訴訟法學五十年回顧與前瞻》（樊崇義、吳宏耀），載《人民檢察》1999年第12期。（《法學復印資料-訴訟制度》2000年第3期全文轉載；獲《人民檢察》雜志社1999年度優秀論文二等獎。）
6.《中國刑事庭審制度的改革與特色》（樊崇義、吳宏耀），載《中國刑事法雜志》2000年第1期。
7.《我國刑事簡易程序使用率低下的原因及對策》，載《法學文稿》2000年創刊號。
8.《刑事自訴制度研究》，載中國政法大學學報《政法論壇》2000年第3期。
9.《不起訴裁量權研究》（宋英輝、吳宏耀），載中國政法大學學報《政法論壇》2000年第5期。
10.《刑事證據前言問題研究》（樊崇義、鎖正杰、吳宏耀、陳永生）（上），載何家弘主編《證據學論壇》（第一卷），中國檢察出版社2000年版。
11.《論我國誘餌偵查制度的立法建構》，載《人民檢察》2001年第2期。（該文獲《人民檢察》雜志社2001年度優秀論文二等獎。）
12.《外國證據規則的立法及發展》（宋英輝、吳宏耀），載《人民檢察》2001第3期。
13.《刑事證據前言問題研究》（樊崇義、鎖正杰、吳宏耀、陳永生）（下），載《證據學論壇》（第二卷），中國檢察出版社2001年版。
14.《聯性規則》（宋英輝、吳宏耀），載《人民檢察》2001第4期。
15.《傳聞規則》（宋英輝、吳宏耀），載《人民檢察》2001年第6期。
16.《意見規則》（宋英輝、吳宏耀），載《人民檢察》2001年第7期。
17.《英國逮捕制度新發展》，載《國家檢察官學院學報》2001年第2期。
18.《酌定不起訴決定的實體效力》（樊崇義、吳宏耀），載《人民檢察》2001年第8期。
19.《偵查訊問制度研究》，載《中國刑事法雜志》2001年第5期。
20.《刑事證明標準研究述評》，載樊崇義主編《訴訟法學研究》（第一卷），中國檢察出版社2002年1月版。
21.《論證據裁判原則》，載最高人民檢察院法律政策研究室編《法律應用研究》2001年第六期。
22.《論刑事證據規則極其制度構建》（宋英輝、吳宏耀），載《中國司法審判論壇》第一卷，法律出版社2001年12月版。
23.《訴訟證明論綱》，載陳興良主編《刑事法雜志》（第十一卷），中國政法大學出版社2002年5月版。
24.《訴訟認識之結構分析》，載樊崇義主編《訴訟法學研究》（第五卷），中國檢察出版社2002年11月版。
25.《社會認知背景下的訴訟認識》，載王敏遠主編《公法》（第四卷），法律出版社2004年版。
26.《試論裁判事實的客觀性》，載鄭永流主編《法哲學與法社會學論叢》（第六卷），中國政法大學出版社2003年12月版。
27.《口供問題的真相》，載樊崇義主編《中國訴訟法判解》（第一卷），中國檢察出版社2003年版。
28.《論證據的自由評價》，載陳光中主編《訴訟法論叢》（第八卷），法律出版社2003年版。
29.《現代法視野下的刑事訴訟》，載《政法論壇》2004年第三期。
30.《刑事偵查中的事實發現》，載郝宏奎主編《偵查論叢》，法律出版社2004年版。
31.《刑事公訴制度的定位與改革》，載《法商研究》2004年第四期。
32.《司法裁判中的事實問題》，載《法學研究》2004年第六期。
33.《事實與規范之間》，載 鄭永流主編《法哲學與法社會學論叢》（第六卷），中國政法大學出版出版社2004年版 。
34.《刑事辯護的困境與出路》（吳宏耀、張燕），載《中國司法》2004年第12期。
35.《雙重視角下的案件事實》，載陳澤憲主編《刑事法前沿》（第二卷），中國人民公安大學出版社2005年版。
36．《刑事訴訟致力于事實真相么？》（托馬斯·魏根特著），載何家弘主編《證據學論壇》（第十卷），中國檢察出版社2005年版 。
短論
1.《刑事精神損害的賠償問題》，載《檢察日報》2000年10月19日第5版。
2．《完善刑事證據規則的原則和要求》，載《人民法院報》2000年11月13日第3版。
3．《權利行使的限度》，載《中國婦女報》2000年12月2日第4版。
4．《刑事訴訟證明解析》，載《檢察日報》2000年12月7日第3版。
5．《我國證據立法勢在必行》，載《人民法院報》2000年12月11日第3版。（《法學復印資料-訴訟法學》2001年第1期全文轉載。）
6．《權威性知識與訴訟證明》，載《法制日報》2000年12月17日第3版。
7．《證言的可信性與證人出庭作證》，載《中國婦女報》2001年2月10日第4版。
8．《質疑“私自錄音不得作為證據”》，載《中國婦女報》2001年4月7日。
9．《刑事證明標準的基點：程序正義抑或實體正義》，載《法制日報》2001年4月15日。
10．《我國應當確立行政簡易裁判程序》，載《人民法院報》2001年4月22日。
11．《刑事證明標準與非至上性》，載《檢察日報》2001年5月1日。
12．《刑事證明與檢察責任》，載《檢察日報》2001年8月10日。
13．《法律真實與客觀真實的論爭》，載《檢察日報》2001年10月12日 。
14．《包公斷案中的臆斷》，載《深圳法制報》2001年10月
15．《證明標準的立法視角》，載《檢察日報》2001年10月26日
16．《證明標準與現實中的刑事裁判》，載《檢察日報》
17．《法律真實與人權保障》，載《檢察日報》 2001年11月13日
18．《證明標準與裁判事實》，載《人民法院報》 2002年2月
19．《刑事證明標準的背面：無罪裁判》，載《人民法院報》2002年3月
20．《證據的概念及相關問題》，載《法制日報》2003年7月17日
21．《法律平等保護的兩張面孔》，載《法制日報》2004/12/3
22．《如何準確理解訴訟法學意義上的案件》，載《檢察日報》2004/12/15
23．《關注少年刑事司法制度》，載《法制日報》2005/6/1
24．《北京規則檢討》, 載《法制早報》2005/6
25．《監獄不是完整意義的偵查機關》, 載《檢察日報》2005/8
26．《開庭審理前，檢察機關可以撤訴》, 載《檢察日報》2005/9/15日三版