勞動糾紛先申請仲裁，向人社局提出，不收費，對仲裁不服的再起訴。
勞動爭議調(diào)解仲裁法
第二條 中華人民共和國境內(nèi)的用人單位與勞動者發(fā)生的下列勞動爭議，適用本法：
（一）因確認(rèn)勞動關(guān)系發(fā)生的爭議；
（二）因訂立、履行、變更、解除和終止勞動合同發(fā)生的爭議；
（三）因除名、辭退和辭職、離職發(fā)生的爭議；
（四）因工作時間、休息休假、社會保險、福利、培訓(xùn)以及勞動保護(hù)發(fā)生的爭議；
（五）因勞動報酬、工傷醫(yī)療費、經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償或者賠償金等發(fā)生的爭議；
（六）法律、法規(guī)規(guī)定的其他勞動爭議。

第五條 發(fā)生勞動爭議，當(dāng)事人不愿協(xié)商、協(xié)商不成或者達(dá)成和解協(xié)議后不履行的，可以向調(diào)解組織申請調(diào)解；不愿調(diào)解、調(diào)解不成或者達(dá)成調(diào)解協(xié)議后不履行的，可以向勞動爭議仲裁委員會申請仲裁；對仲裁裁決不服的，除本法另有規(guī)定的外，可以向人民法院提起訴訟。
第六條 發(fā)生勞動爭議，當(dāng)事人對自己提出的主張，有責(zé)任提供證據(jù)。與爭議事項有關(guān)的證據(jù)屬于用人單位掌握管理的，用人單位應(yīng)當(dāng)提供；用人單位不提供的，應(yīng)當(dāng)承擔(dān)不利后果。
第四十八條 勞動者對本法第四十七條規(guī)定的仲裁裁決不服的，可以自收到仲裁裁決書之日起十五日內(nèi)向人民法院提起訴訟。
第四十九條 用人單位有證據(jù)證明本法第四十七條規(guī)定的仲裁裁決有下列情形之一，可以自收到仲裁裁決書之日起三十日內(nèi)向勞動爭議仲裁委員會所在地的中級人民法院申請撤銷裁決：
（一）適用法律、法規(guī)確有錯誤的；
（二）勞動爭議仲裁委員會無管轄權(quán)的；
（三）違反法定程序的；
（四）裁決所根據(jù)的證據(jù)是偽造的；
（五）對方當(dāng)事人隱瞞了足以影響公正裁決的證據(jù)的；
（六）仲裁員在仲裁該案時有索賄受賄、徇私舞弊、枉法裁決行為的。
人民法院經(jīng)組成合議庭審查核實裁決有前款規(guī)定情形之一的，應(yīng)當(dāng)裁定撤銷。
仲裁裁決被人民法院裁定撤銷的，當(dāng)事人可以自收到裁定書之日起十五日內(nèi)就該勞動爭議事項向人民法院提起訴訟。
第五十條 當(dāng)事人對本法第四十七條規(guī)定以外的其他勞動爭議案件的仲裁裁決不服的，可以自收到仲裁裁決書之日起十五日內(nèi)向人民法院提起訴訟；期滿不起訴的，裁決書發(fā)生法律效力。
第五十一條 當(dāng)事人對發(fā)生法律效力的調(diào)解書、裁決書，應(yīng)當(dāng)依照規(guī)定的期限履行。一方當(dāng)事人逾期不履行的，另一方當(dāng)事人可以依照民事訴訟法的有關(guān)規(guī)定向人民法院申請執(zhí)行。受理申請的人民法院應(yīng)當(dāng)依法執(zhí)行。

發(fā)生勞動糾紛，那么先反映到就業(yè)局解決。就業(yè)局不處理的，反映到仲裁委員會處理，不服裁決的，在裁決書下達(dá)之日起15天內(nèi)，到當(dāng)?shù)厝嗣穹ㄔ荷显V。

勞動合同糾紛只能申請勞動仲裁，未經(jīng)仲裁法院不受理。

先協(xié)商，各退一步，盡量不要走到仲裁或訴訟的地步。如果雙扣無法協(xié)商達(dá)成一致，可以申請仲裁，盡量在仲裁委達(dá)成調(diào)解。由于現(xiàn)在判決書都可以公開查詢，一旦訴訟，對雙方都有不好的影響

向單位所在地的區(qū)縣級勞動仲裁院（設(shè)在人社局）申請勞動仲裁，是比較有效的辦法。

發(fā)生勞動合同糾紛申請勞動仲裁最有效。

單位與員工之間發(fā)生勞動糾紛，最有效的處理辦法是雙方進(jìn)行溝通、協(xié)商，找到雙方都能認(rèn)可的解決方案。畢竟勞動仲裁、法院訴訟對雙方都耗費大量時間、精力，對用人單位的形象也有損害。

　　勞動合同糾紛向法院起訴可以按照《訴訟費用交納辦法》進(jìn)行‍收費
　　《訴訟費用交納辦法》
　　第十三條 案件受理費分別按照下列標(biāo)準(zhǔn)交納：
　?。ㄒ唬┴敭a(chǎn)案件根據(jù)訴訟請求的金額或者價額，按照下列比例分段累計交納：
　　1.不超過1萬元的，每件交納50元；
　　2.超過1萬元至10萬元的部分，按照2.5％交納；
　　3.超過10萬元至20萬元的部分，按照2％交納；
　　4.超過20萬元至50萬元的部分，按照1.5％交納；
　　5.超過50萬元至100萬元的部分，按照1％交納；
　　6.超過100萬元至200萬元的部分，按照0.9％交納；
　　7.超過200萬元至500萬元的部分，按照0.8％交納；
　　8.超過500萬元至1000萬元的部分，按照0.7％交納；
　　9.超過1000萬元至2000萬元的部分，按照0.6％交納；
　　10.超過2000萬元的部分，按照0.5％交納。

《民事訴訟法》第25條規(guī)定：合同的雙方當(dāng)事人可以在書面合同中協(xié)議選擇被告住所地、合同履行地、合同簽訂地、原告住所地、標(biāo)的物所在地的人民法院管轄，但不得違反本法對級別管轄和專屬管轄的規(guī)定。
既然你在合同中與用人單位約定管轄法院，依據(jù)《民事訴訟法》之規(guī)定，你只可以向上海的法院提起訴訟。
所以，南寧的法院不受理的裁定是正確的。