以補充協(xié)議為準。補充協(xié)議并未改變主合同的主要目的，也就是買房賣房這個主合同目的未改變，只是在一些細節(jié)上的修改和補充，未經備案并不影響其法律效力，而且，補充協(xié)議是對主合同的修改和完善，即使是同時簽署的，也會以補充協(xié)議上的內容為準的。
簽訂購房合同補充協(xié)議的注意事項如下：
1、對所述套房面積及公攤面積的合理誤差應達成一致，以防止交房時在合同規(guī)定范圍內套房面積減少，增加公共面積。
2、要商定由銀行和開發(fā)商辦理公積金和商業(yè)貸款的原因辦不下來的問題，應當約定，在這種情況下，購房者可以選擇退房，開發(fā)商退還首付款和定金，目的是為了防止開發(fā)商退房，扣除購房者的定金，或者追究違約金。
3、要約定，開發(fā)商在交付房屋時提供測量房屋面積的數(shù)據(jù)，應約定如果開發(fā)商不提供，購房者可以退房或拒收，而開發(fā)商要按日支付，目的是防止購房者在裝修后因裝修等問題而被動。
4、我們要就物業(yè)費、停車費等具體金額達成協(xié)議，以防止開發(fā)商或物業(yè)公司在入住后提價，而購房者并沒有當初開發(fā)商承諾的依據(jù)。
5、商定帶裝修房屋的具體裝修標準，不得被開發(fā)商以"進口"、"高級"、""等不明確的描述誤導，應詳細約定與房屋有關的內外裝飾、設施的種類、型號、顏色、方向、可參考價格等因素，以免對裝修提出異議而無依據(jù)的情況。
6、要就開發(fā)商給購房者辦理產權證的具體時間達成約定，合同中只規(guī)定開發(fā)商提交材料的時間，目的是防止開發(fā)商無限期地給購房者辦理產權證，影響購房者行使權利。
7、商定房屋的屋蓋、外墻使用權歸業(yè)主，開發(fā)商使用時須經業(yè)委會同意，目的是防止開發(fā)商因商業(yè)用途而影響購房者的正常生活。
8、如果合同與補充協(xié)議中沒有約定或者約定不明確的，可以以開發(fā)商發(fā)布的廣告、宣傳品為相關內容的依據(jù)。
法律依據(jù)：
《中華人民共和國民法典》
第五百一十條
合同生效后，當事人就質量、價款或者報酬、履行地點等內容沒有約定或者約定不明確的，可以協(xié)議補充;不能達成補充協(xié)議的，按照合同相關條款或者交易習慣確定。