1. 勞動合同中約定保密條款的合法性：根據我國《勞動法》第22條的規定，勞動合同中雙方可以約定保守用人單位商業秘密的相關事項，這樣的約定是合法的，并且受到法律的保護。
2. 法律依據：依據《勞動法》第102條，如果勞動者違反勞動合同中約定的保密事項，給用人單位造成經濟損失，勞動者應當承擔相應的賠償責任。《違反勞動法有關勞動合同規定的賠償辦法》第5條進一步規定了勞動者違反保密事項的具體賠償責任。
3. 索賠程序：首先，用人單位可以與勞動者協商解決因違反保密協議所造成的經濟損失賠償問題。如果協商不成，用人單位可以根據勞動合同向勞動仲裁委員會申請仲裁。如果仲裁無法解決問題，用人單位還可以依據《反不正當競爭法》直接向有管轄權的人民法院提起訴訟。

簽了保密協議被辭退了是否有賠償金分以下情況：
1、保密協議是否有補償金須看合同的約定，如果約定有保密費用或補償條款，就有補償金；
2、如果保密協議中約定了競業限制條款，并約定在解除或者終止勞動合同后，在競業限制期限內按月給予勞動者經濟補償。勞動者違反競業限制約定的，應當按照約定向用人單位支付違約金。
簽了保密協議被辭退時補償金有以下情況：
1、如果簽了保密協議的話，公司也是要給你補償金的，也就是說，在解除合同之后，除了正常的工資和離職的補償金之外，公司還要另外支付給你一筆補償金的，如果你在約定的時間，你違反了保密合同的約定，公司是可以要求你返還補償金，并且還要補償給公司一定的金額的；
2、按規定，用人單位違法解除或終止勞動合同，應按經濟補償標準的二倍支付勞動者賠償金。經濟補償的標準為：勞動者在本單位每滿一年工作支付一個月工資。超過半年不滿一年，按一年算；不滿半年支付半個月工資。最高為12個月工資。月工資為：本人最近一年工資的月平均數；
3、經勞動合同當事人協商一致，由用人單位解除勞動合同的，用人單位應根據勞動者在本單位工作年限，每滿一年發給相當于一個月工資的經濟補償金，最多不超過十二個月。工作時間不滿一年的按一年的標準發給經濟補償金。
綜上所訴，對負有保密義務的勞動者，用人單位可以在勞動合同或者保密協議中與勞動者約定競業限制條款，并約定在解除或者終止勞動合同后，在競業限制期限內按月給予勞動者經濟補償。勞動者違反競業限制約定的，應當按照約定向用人單位支付違約金。
法律依據：
《中華人民共和國勞動合同法》第二十三條
用人單位與勞動者可以在勞動合同中約定保守用人單位的商業秘密和與知識產權相關的保密事項。

保密協議的賠償條款主要依據給公司造成的實際損失。若員工違反保密協議，泄露公司機密，導致損失，需承擔賠償責任，賠償額度以實際損失為基準。
保密協議不能取代勞動合同。若存在勞動關系，雙方需簽訂勞動合同；若為合作關系，則只需簽訂保密協議。雖然保密協議源于勞動關系，但可單獨訂立，具備法律效力。
保密協議需包括明確保密信息范圍、保密主體、保密期限及雙方權利義務等內容。明確保密信息范圍時，應具體列舉所有需要保密的內容，及時更新保密協議內容以適應不同企業和不同時期的保密需求。保密主體通常限于涉密崗位的勞動者，但工作中意外獲取秘密的非涉密崗位勞動者亦應納入保密范圍。同時，對保密信息的使用、職務成果歸屬、文件保存銷毀方式等進行詳細規定。
保密協議中的保密期限需明確，由于商業秘密可能存在過期、被公開或淘汰的情況，約定保密義務的起止時間有助于避免不必要的法律糾紛。此外，保密協議應清晰界定雙方的權利與義務，確保雙方在使用、保護和管理商業秘密時的法律地位明確。

保密協議中的違約金賠償標準由雙方在協議簽訂時共同確定。如果勞動者遵守了競業限制條款，但協議中未明確具體的賠償金額，用人單位應根據勞動者解除或終止勞動合同前十二個月的平均工資，支付相當于該工資30%的經濟補償，但此補償不得低于當地規定的最低工資標準，并且應按月支付。
根據《中華人民共和國勞動合同法》第二十三條的規定，用人單位在與勞動者簽訂勞動合同時，可以就保守用人單位商業秘密和與知識產權相關的保密事項達成協議。對于有保密義務的勞動者，用人單位可以在勞動合同或單獨的保密協議中設定競業限制條款，并約定在勞動合同解除或終止后的一定期限內，向勞動者支付經濟補償。如果勞動者違反競業限制條款，則應當按照事先約定的違約金金額進行賠償。
勞動合同解除或終止時的經濟補償金計算標準如下：
1. 經濟補償金根據勞動者在用人單位工作的年限來計算，每滿一年支付相當于一個月工資的經濟補償。
2. 如果工作期限在六個月以上但不滿一年，按一年計算經濟補償。
3. 如果工作期限不滿六個月，則支付相當于半個月工資的經濟補償。