【分析解答】
合作合同如果出現糾紛情況可以先與當事人協商；當事人不愿協商或者協商不成時，可以收集證據到法院起訴，請求法院支持訴訟請求；如果合作合同中有仲裁條款的，則通過申請仲裁的方式解決糾紛。
【法律依據】
《中華人民共和國民法典》
第十條 處理民事糾紛，應當依照法律；法律沒有規定的，可以適用習慣，但是不得違背公序良俗。
《中華人民共和國民事訴訟法》
第二編 審判程序
第十二章 第一審 普通程序
第一節 起訴和受理
第一百二十二條 起訴必須符合下列條件：
（一）原告是與本案有直接利害關系的公民、法人和其他組織；
（二）有明確的被告；
（三）有具體的訴訟請求和事實、理由；
（四）屬于人民法院受理民事訴訟的范圍和受訴人民法院管轄。
第一百二十三條 起訴應當向人民法院遞交起訴狀，并按照被告人數提出副本。
書寫起訴狀確有困難的，可以口頭起訴，由人民法院記入筆錄，并告知對方當事人。
第一百二十四條 起訴狀應當記明下列事項：
（一）原告的姓名、性別、年齡、民族、職業、工作單位、住所、聯系方式，法人或者其他組織的名稱、住所和法定代表人或者主要負責人的姓名、職務、聯系方式；
（二）被告的姓名、性別、工作單位、住所等信息，法人或者其他組織的名稱、住所等信息；
（三）訴訟請求和所根據的事實與理由；
（四）證據和證據來源，證人姓名和住所。
第一百二十五條 當事人起訴到人民法院的民事糾紛，適宜調解的，先行調解，但當事人拒絕調解的除外。
第一百二十六條 人民法院應當保障當事人依照法律規定享有的起訴權利。對符合本法第一百二十二條的起訴，必須受理。符合起訴條件的，應當在七日內立案，并通知當事人；不符合起訴條件的，應當在七日內作出裁定書，不予受理；原告對裁定不服的，可以提起上訴。
第一百二十七條 人民法院對下列起訴，分別情形，予以處理：
（一）依照行政訴訟法的規定，屬于行政訴訟受案范圍的，告知原告提起行政訴訟；
（二）依照法律規定，雙方當事人達成書面仲裁協議申請仲裁、不得向人民法院起訴的，告知原告向仲裁機構申請仲裁；
（三）依照法律規定，應當由其他機關處理的爭議，告知原告向有關機關申請解決；
（四）對不屬于本院管轄的案件，告知原告向有管轄權的人民法院起訴；
（五）對判決、裁定、調解書已經發生法律效力的案件，當事人又起訴的，告知原告申請再審，但人民法院準許撤訴的裁定除外；
（六）依照法律規定，在一定期限內不得起訴的案件，在不得起訴的期限內起訴的，不予受理；
（七）判決不準離婚和調解和好的離婚案件，判決、調解維持收養關系的案件，沒有新情況、新理由，原告在六個月內又起訴的，不予受理。
第二節 審理前的準備
第一百二十八條 人民法院應當在立案之日起五日內將起訴狀副本發送被告，被告應當在收到之日起十五日內提出答辯狀。答辯狀應當記明被告的姓名、性別、年齡、民族、職業、工作單位、住所、聯系方式；法人或者其他組織的名稱、住所和法定代表人或者主要負責人的姓名、職務、聯系方式。人民法院應當在收到答辯狀之日起五日內將答辯狀副本發送原告。
被告不提出答辯狀的，不影響人民法院審理。
第一百二十九條 人民法院對決定受理的案件，應當在受理案件通知書和應訴通知書中向當事人告知有關的訴訟權利義務，或者口頭告知。
第一百三十條 人民法院受理案件后，當事人對管轄權有異議的，應當在提交答辯狀期間提出。人民法院對當事人提出的異議，應當審查。異議成立的，裁定將案件移送有管轄權的人民法院；異議不成立的，裁定駁回。
當事人未提出管轄異議，并應訴答辯的，視為受訴人民法院有管轄權，但違反級別管轄和專屬管轄規定的除外。
第一百三十一條 審判人員確定后，應當在三日內告知當事人。
第一百三十二條 審判人員必須認真審核訴訟材料，調查收集必要的證據。
第一百三十三條 人民法院派出人員進行調查時，應當向被調查人出示證件。
調查筆錄經被調查人校閱后，由被調查人、調查人簽名或者蓋章。
第一百三十四條 人民法院在必要時可以委托外地人民法院調查。
委托調查，必須提出明確的項目和要求。受委托人民法院可以主動補充調查。
受委托人民法院收到委托書后，應當在三十日內完成調查。因故不能完成的，應當在上述期限內函告委托人民法院。
第一百三十五條 必須共同進行訴訟的當事人沒有參加訴訟的，人民法院應當通知其參加訴訟。
第一百三十六條 人民法院對受理的案件，分別情形，予以處理：
（一）當事人沒有爭議，符合督促程序規定條件的，可以轉入督促程序；
（二）開庭前可以調解的，采取調解方式及時解決糾紛；
（三）根據案件情況，確定適用簡易程序或者普通程序；
（四）需要開庭審理的，通過要求當事人交換證據等方式，明確爭議焦點。