國有土地房屋的賠償是：房屋征收補償費，以被拆遷房屋的結構和折舊程度劃檔，按平方米單價計算；房屋征收周轉補償費，以臨時居住條件劃檔，按被拆遷房屋住戶的人口每月予以補貼；房屋征收獎勵性補償費，由當地人民政府根據本地的實際情況和國家有關法律政策加以確定。

《國有土地上房屋征收與補償條例》 第十七條

作出房屋征收決定的市、縣級人民政府對被征收人給予的補償包括：

（一）被征收房屋價值的補償；

（二）因征收房屋造成的搬遷、臨時安置的補償；

（三）因征收房屋造成的停產停業損失的補償。

市、縣級人民政府應當制定補助和獎勵辦法，對被征收人給予補助和獎勵。

根據《國有土地上房屋征收與補償條例》第17條規定，對被征收人的補償包括：

(一)被征收房屋價值的補償;

(二)因征收房屋造成的搬遷、臨時安置的補償;

(三)因征收房屋造成的停產停業損失的補償。

這里規定的只是對征收國有土地上的房屋價值的補償，但是根據《國有土地上房屋征收與補償條例》第13條的規定：房屋被依法征收的，國有土地使用權同時收回。對國有土地上的房屋價值進行補償后，國有土地使用權是無償收回的，對征收房屋價值的補償就包含了土地使用權的補償，土地使用權的價值應包含在房屋的價值之中。